26 августа 2007 года Уилсон был доставлен в больницу Санта-Моники после попытки самоубийства. По сообщениям прессы, актер принял большое количество лекарств, после чего вскрыл себе вены на обоих запястьях.
В октябре 2018 Варуни Вонгсвиратес родила актеру дочь Лайлу.
Отец - Роберт Уилсон – родился в 1941 году. Мать - Лаура Уилсон – родилась в 1939 году.
Оуэн является младшим братом Эндрю Уилсона и старшим Люка Уилсона.
Родители Оуэна ирландского происхождения.
Полное имя — Оуэн Каннингем Уилсон (Owen Cunningham Wilson).
Оуэн - левша.
30 января 2014 года стал отцом во второй раз: его личный тренер Кэролайн Линдквист родила сына, которого назвали Финн Линдквист Уилсон.
В 2011 году Оуэн стал отцом. Его девушка, Джейд Дуэлл, родила ему сына. Мальчика назвали Роберт Форд Уилсон.
